Atividade 05

Atividade 05 - COVID-19 na Região de Campinas e Estado de SP

O conjunto de dados spdata presente no arquivo spdata.rda possui informações acerca do número acumulado de casos e óbitos confirmados em três diferentes níveis:

• Estado de SP
• Região Metropolitana de Campinas (RMC)
• Região Metropolitana de Campinas (RMC) + Piracicaba + Limeira: municípios atendidos por campi da UNICAMP
• Municípios da RMC

Para carregar os dados, você precisará utilizar o pacote tidyverse, como sugerido abaixo:

library(tidyverse)
load("../dados/spdata.rda")

date	city	place_type	confirmed	deaths	estimated_population_2019
2020-02-25	SP (Estado)	state	1	0	45919049
2020-02-26	SP (Estado)	state	1	0	45919049
2020-02-27	SP (Estado)	state	1	0	45919049
2020-02-28	SP (Estado)	state	2	0	45919049
2020-02-29	SP (Estado)	state	2	0	45919049
2020-03-01	SP (Estado)	state	2	0	45919049

Para obter dados de um município, você pode aplicar filtros utilizando a coluna city. Por exemplo, para os casos e óbitos ocorridos em Jundiaí:

spdata %>% filter(city == "Jundiaí") %>% head() %>%  knitr::kable()

date	city	place_type	confirmed	deaths	estimated_population_2019
2020-03-25	Jundiaí	city	1	0	418962
2020-03-26	Jundiaí	city	2	0	418962
2020-03-27	Jundiaí	city	3	0	418962
2020-03-30	Jundiaí	city	3	0	418962
2020-03-31	Jundiaí	city	3	0	418962
2020-04-01	Jundiaí	city	5	0	418962

Estas informações podem ser utilizadas para compor os gráficos de casos e óbitos acumulados:

library(ggplot2)
spdata %>% filter(city == "Jundiaí") %>% 
  ggplot(aes(date, confirmed)) + geom_point() + theme_bw() +
  xlab("Data") + ylab("Casos confirmados até a data") + ggtitle("Casos Confirmados")

spdata %>% filter(city == "Jundiaí") %>% 
  ggplot(aes(date, deaths)) + geom_point() + theme_bw() +
  xlab("Data") + ylab("Óbitos confirmados até a data") + ggtitle("Óbitos Confirmados")

Questões

1. Escolha três municípios (ou regiões) de interesse;
2. Apresente um modelo de regressão para casos acumulados para cada uma das escolhas acima;
3. Apresente um modelo de regressão para óbitos acumulados para cada uma das escolhas acima;
4. Apresente um modelo de regressão para casos diários para cada uma das escolhas acima;
5. Apresente um modelo de regressão para óbitos diários para cada uma das escolhas acima;
6. Apresente o código necessário para a realização de todas as atividades aqui descritas.